Zastąpienie kierownictwa centrum
W większych firmach i przedsiębiorstwach zwyczajowo przypisuje się wydatki i dochody do poszczególnych ośrodków. Proces ten jest zazwyczaj bardzo czasochłonny i wymagający pod względem administracyjnym i często nie rozwiązuje problemu alokacji kosztów usług pomiędzy poszczególnymi ośrodkami. Alternatywą dla zarządzania centralnego jest wykorzystanie jednostek organizacyjnych w Navigo. Jednostki organizacyjne zastępują skomplikowane przekazywanie dokumentów i doładowywanie pozycji z jednego centrum do drugiego.
Aby skorzystać z tej funkcji, wystarczy przypisać poszczególnych pracowników do określonej jednostki organizacyjnej w Navigo, a system automatycznie rozpozna, który dział powinien zostać obciążony za ich pracę. Samodzielnie ocenia również procentowy udział danego działu w zyskach lub stratach projektu.
Jednostki organizacyjne umożliwiają porównanie poszczególnych działów lub oddziałów ze sobą, zapewniając jednocześnie przegląd udziału działów usług w przychodach i wydatkach projektu.